个人介绍:
张迪,开云官方在线登陆入口助理教授,北京大学博雅青年学者、基因功能研究与操控全国重点实验室、北大-清华生命科学联合中心研究员。从事代谢信号与细胞适应的分子机制研究。张迪研究员毕业于北京大学基础医学院八年制,师从尚永丰院士,从事表观遗传与基因转录调控在肿瘤发生发展中的分子机制研究;在芝加哥大学开展博士后研究工作,与Louis Block 讲席教授赵英明合作,首次发现哺乳动物细胞中代谢产物(如乳酸、酮体等)可以驱动新型蛋白质修饰——赖氨酸乳酰化修饰等,累积被引用超过10000次。
教育经历:
2010 - 2013,理学博士,生物化学与分子生物学,北京大学
2005 - 2010,医学学士,基础医学,北京大学
工作经历:
2021.3 - 今,研究员,北大清华生命科学联合中心
2021.3 - 今,研究员,开云官方在线登陆入口
2013.9 - 2021.1,博士后,美国芝加哥大学 Ben May Department for Cancer Research社会服务工作:
长期为Cell、 Cell Metabolism、Cell Research、Nature Metabolism、Nature Cancer、Nature Chemical Biology等学术主流期刊审稿。荣誉奖励:
北京市杰出青年科学基金,2026,
北京大学教学优秀奖,2025
北京大学第二十四届青年教师教学基本功比赛优秀指导教师奖,2025
北京大学东宝奖教金,2023
北京大学第二十二届青年教师教学基本功比赛一等奖,优秀教案奖、最佳教学演示奖、最受学生欢迎奖、课程思政奖,2023
北京大学博雅青年学者,2022
北京大学优秀工会积极分子,2022
国家自然科学优秀青年基金(海外),2022
拜耳学者,2021
億方学者,2021学术任职:
中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业分会 委员教材编撰:
《生物化学》教育部101教材执教课程:
分子生物学,本科生 (独立)
生物化学讨论课,本科生(独立)
生物化学与分子生物学研究前沿,本科生
生物化学与分子生物学科研实践,本科生
生物化学与分子生物学科研规范与毕业论文,本科生
生物化学及分子生物学进展,研究生
生命科学实验基础,研究生
代谢信号与细胞适应实验室
我们致力于研究代谢如何作为一种信号与信息处理系统,调控细胞适应及疾病进程。
传统上,代谢主要被视为细胞获取能量和合成生物大分子的基础。我们的研究试图揭示代谢更为重要而广泛的调控功能:细胞如何感知代谢状态的变化,并将其编码和传递为调控信号,从而塑造细胞功能与适应性。
实验室的研究建立在对代谢物直接调控细胞过程的研究基础之上。张迪博士在芝加哥大学 Yingming Zhao 教授实验室开展博士后研究期间,发现乳酸、酮体等代谢物能够驱动此前未被认识的蛋白质翻译后修饰,包括赖氨酸乳酰化。这项工作建立了代谢状态与基因调控之间的直接分子联系,并推动了代谢作为细胞信号调控重要层面的认识。相关研究已获得超过10,000次引用。
在此基础上,我们进一步探索代谢感知、信号传递与细胞适应的基本规律。我们研究代谢物及代谢通路如何与蛋白质、信号转导、转录及其他细胞调控网络相互作用,以及这些调控过程如何在不同细胞区室和时间尺度上实现协调。与此同时,我们关注癌细胞如何重塑这些代谢与调控网络,以适应代谢和环境压力,促进肿瘤进展与转移,并形成可干预的代谢脆弱性。
我们的研究主要围绕以下三个相互关联的方向展开:
1. 代谢感知与细胞适应中的信号调控
研究细胞如何感知代谢状态变化,并将其转化为调控信号,从而控制细胞功能与适应。
2. 代谢驱动的细胞功能与信号网络调控
研究代谢物及代谢通路如何在时间和空间上协调地调控细胞信号、转录及其他调控网络。
3. 癌症中的代谢重编程与适应性可塑性
研究癌细胞如何重塑代谢及其调控网络,以适应环境和治疗压力,促进肿瘤进展与转移,并形成可靶向的代谢脆弱性。
通过连接代谢、信号转导与细胞适应,我们希望揭示代谢信息如何控制细胞行为的基本规律,并将这些机制转化为理解和干预疾病的新思路。
(*Co-first author, # Corresponding author)
(1) Ren H, Tang Y, Zhang D#. (2025).The emerging role of protein l-lactylation in metabolic regulation and cell signalling. Nat Metab 7: 647–664.
(2) Zhang D#, Gao J, Zhu Z, Mao Q, Xu Z, Singh PK, Rimayi CC, Moreno-Yruela C, Xu S, Li G, Sin YC, Chen Y, Olsen CA, Snyder NW, Dai L, Li L, Zhao Y. (2025). Lysine L-lactylation is the dominant lactylation isomer induced by glycolysis. Nat Chem Biol. 21(1): 91–99.
(3) Ren H, Zhang D#. (2024). Lactylation constrains OXPHOS under hypoxia. Cell Res. 34(2): 91-92.
(4) Gao J, Sheng X, Du J, Zhang D, Han C, Chen Y, Wang C, Zhao Y. (2023). Identification of 113 new histone marks by CHiMA, a tailored database search strategy. Sci Adv. 9(14): eadf1416.
(5) Moreno-Yruela C, Zhang D*, Wei W, Bæk M, Liu W, Gao J, Danková D, Nielsen AL, Bolding JE, Yang L, Jameson ST, Wong J, Olsen CA, Zhao Y. (2022). Class I histone deacetylases (HDAC1-3) are histone lysine delactylases. Sci Adv. 8(3): eabi6696.
(6) Huang H, Zhang D*, Weng Y, Delaney K, Tang Z, Yan C, Qi S, Peng C, Cole PA, Roeder RG, Zhao Y. (2021). The regulatory enzymes and protein substrates for the lysine β-hydroxybutyrylation pathway. Sci Adv. 7(9): eabe2771.
(7) Zhang D*, Tang Z*, Huang H, Zhou G, Cui C, Weng Y, Liu W, Kim S, Lee S, Perez-Neut M, Czyz D, Hu R, Ye Z, He M, Zheng YG, Shuman H, Ding J, Dai L, Ren B, Robert RG, Becker L, Zhao Y. (2019). Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 574: 575-580.
(8) Huang H, Zhang D, Wang Y, Perez-Neut M, Han Z, Zheng YG, Hao Q, Zhao Y. (2018). Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2. Nat Commun. 9(1): 3374.
(9) Sabari BR*, Zhang D*, Allis CD, Zhao Y. (2017). Metabolic Regulation of Gene Expression through Differential Histone Acylation. Nat Rev Mol Cell Biol. 18(2): 90-101.
(10) Xie Z*, Zhang D*, Chung D*, Tang Z, Huang H, Dai L, Qi S, Li J, Colak G, Chen Y, Xia C, Peng C, Ruan H, Kirkey M, Wang D, Jensen LM, Kwon OK, Lee S, Pletcher SD, Tan M, Lombard DB, White KP, Zhao H, Li J, Roeder RG, Yang X, Zhao Y. (2016). Metabolic Regulation of Gene Expression by Histone Lysine beta-hydroxybutyrylation. Mol Cell. 62(2): 194-206.
(11) Goudarzi A*, Zhang D*, Huang H, Barral S, Kwon OK, Qi S, Tang Z, Buchou T, Vitte AL, He T, Cheng Z, Montellier E, Gaucher J, Curtet S, Debernardi A, Charbonnier G, Puthier D, Petosa C, Panne D, Rousseaux S, Roeder RG, Zhao Y, Khochbin S. (2016). Dynamic Competing Histone H4 K5K8 Acetylation and Butyrylation Are Hallmarks of Highly Active Gene Promoters. Mol Cell. 62(2): 169-80.
(12) Zhang Y*, Zhang D*, Liang J, Yi X, Gui B, Yu W, Sun L, Yang X, Han X, Chen Z, Liu S, Si W, Yan R, Wang Y, Shang Y. (2016). Nucleation of DNA Repair Factors by FOXA1 Links DNA Demethylation to Transcriptional Pioneering. Nat Genet. 48(9): 1003-13.